La Comisión Nacional de los Derechos Humanos emitió sendas recomendaciones a la Secretaría del Medio Ambiente y Recursos Naturales, la Procuraduría Federal de Protección al Ambiente y la Comisión Nacional del Agua por omisiones importantes en la protección de humedales en Chiapas y en la comunidad sonorense de La Colorada. En ambos casos también se responsabiliza a los gobiernos estatales. En la primera recomendación, la CNDH detectó violaciones a los derechos al medio ambiente, al agua y a la vivienda, y por la invasión y destrucción de los humedales de montaña La Kisst y María Eugenia, áreas naturales protegidas.