Un tribunal federal con sede en el estado de México determinó que el magistrado Isidro Avelar Gutiérrez puede enfrentar en prisión domiciliaria la acusación por enriquecimiento ilícito, a pesar de que ha sido señalado por el Departamento del Tesoro de Estados Unidos de haber recibido sobornos del cártel Jalisco Nueva Generación (CJNG) para beneficiar a integrantes de ese grupo delictivo, y que presuntamente es investigado por la Fiscalía General de la República (FGR) por delincuencia organizada.
El caso por el que se encontraba en prisión desde 2019 es por el delito de enriquecimiento ilícito por más de 12 millones de pesos y este procedimiento fue instaurado en su contra por la fiscalía anticorrupción.
Avelar Gutiérrez fue incluido en mayo de 2019 en la lista que el Departamento del Tesoro estadunidense elabora para dar a conocer a personas que están involucradas con organizaciones criminales; en la fecha en que informó sobre el involucramiento del magistrado en la recepción de sobornos del CJNG también apareció el ex gobernador de Nayarit, Roberto Sandoval Castañeda.
Avelar Gutiérrez fue responsable de liberar en 2016 a Rubén Oseguera González, El Menchito, hijo de Nemesio Oseguera, a quien se considera líder de dicha organización criminal. Según las investigaciones de las autoridades, habría recibido en su momento ranchos, dinero en efectivo, inmuebles y vehículos en pago por sus resoluciones.
El funcionario fue detenido el 22 de noviembre de 2019 en Guadalajara, Jalisco, trasladado en ese entonces por personal de la FGR a la Ciudad de México, y posteriormente fue presentado ante un juez federal en Almoloya de Juárez, quien lo vinculó a proceso por el delito de enriquecimiento ilícito.
En mayo de ese año, el Consejo de la Judicatura Federal (CJF) lo suspendió temporalmente sin goce de sueldo por seis meses, al advertir que se habían realizado una serie de operaciones dentro del sistema financiero nacional que alertaban que podría estar obteniendo parte de su patrimonio mediante operaciones con recursos de procedencia ilícita.